Генетический подход в оценке биоразнообразия атлантических осетров Acipenser oxyrinchus и A. sturio (обзор современной литературы)
https://doi.org/10.36038/2307-3497-2023-194-44-49
Аннотация
Цель обзора: обобщение современных данных о филогенетических взаимоотношениях двух осетровых видов, североамериканского атлантического осётра Acipenser oxyrinchus и европейского атлантического осетра A. sturio, обитавшего в Балтийском море, в свете полной утраты A. sturio и наличия небольшого количества особей A. oxyrinchus.
Используемые методы: сравнительный анализ современных литературных данных, метод деконструкции, при котором тщательно были отобраны исследования, отражающие молекулярно-генетические характеристики видов.
Результатом обзора являются структурированные данные по молекулярно-генетическим исследованиям двух видов осетровых. Объединение методов исследований, проводимых с этими видами в одном обзоре.
Значимость: результаты обобщения необходимы для организации мероприятий по восстановлению утраченной вследствие чрезмерного вылова и изменений среды обитания популяции осетра, обитавшего в водоёмах бассейна Балтийского моря. Системный подход к молекулярно-генетическому маркированию рыб как в дикой природе, так и на рыбоводных предприятиях обеспечит контроль выпускаемой молоди, что облегчит дальнейшие исследования в этой области.
Ключевые слова
При поддержке: Работа выполнена в соответствии с государственным заданием № 076–00004–23–01 на 2023 г. по научному направлению «Прикладное научное исследование».
Об авторах
Д. К. Митрюшкина
Санкт-Петербургский филиал ФГБНУ «ВНИРО» («ГосНИОРХ» им. Л.С. Берга»)
Россия
Россия
наб. Макарова, 26, Санкт-Петербург, 199053
М. Н. Киселева
Санкт-Петербургский филиал ФГБНУ «ВНИРО» («ГосНИОРХ» им. Л.С. Берга»)
Россия
Россия
наб. Макарова, 26, Санкт-Петербург, 199053
Список литературы
1. Artyukhin E., Vecsei P. 2007. On the status of Atlantic sturgeon: conspecificity of European Acipenser sturio and North American Acipenser oxyrinchus // J. Appl. Ichthyol. 15(4– 5):35–37. DOI: 10.1111/j.1439-0426.1999.tb00202.x.
2. Birstein V. J., DeSalle R. 1998. Molecular phylogeny of Acipenseridae // Mol. Phylogenet Evol. 9: 141–155.
3. Birstein V.J., Doukakis P. 2000. Molecular analysis of Acipenser sturio, L., 1758 and A. oxyrinchus Mitchill, 1815: a review // Bol. Inst. Exp. Oceanogr. 16:61–73.
4. Birstein V.J., Doukakis P., DeSalle R. 2002. Molecular phylogeny of Acipenseridae: Nonmonophyly of Scaphirhynchinae // Copeia. 2:287–301. DOI: 10.1643/0045-8511(2002)002[0287:MPOANS]2.0.CO;2.
5. Borodin N. 1925. Biological observations on the Atlantic sturgeon (Acipenser sturio) // Trans. Am. Fish. Soc. 55:184– 190.
6. Brown J.T., Beckenbach A.T., Smith M.J. 1993. Intraspecific DNA sequence variation of the mitochondrial control region of white sturgeon (Acipenser transmontanus) // Mol. Biol. Evol. 10: 326–341.
7. Desse-Berset N. 2009. First archaeozoological identification of Atlantic sturgeon (Acipenser oxyrinchus Mitchill 1815) in France // CR Pale vol. 8:717–724. DOI: 10.1016/j.crpv.2009.06.11.
8. Guindon S, Gascuel O. 2003. A Simple, fast, and accurate algorithm to estimate large phylogenies by maximum likelihood. // Syst Biol 52:696–704. DOI: 10.1080/10635150390235520.
9. Fontana F., Massimo L., Kirschbaum F., Garrido-Ramos M. 2008. Comparison of karyotypes of Acipenser oxyrinchus and A. sturio by chromosome banding and fluorescent in situ hybridization // Genetica 132(3):281–6. DOI: 10.1007/s10709-007-9171-4.
10. Fontana F., Tagliavini J., Congiu L. 2001. Sturgeon genetics and cytogenetics: Recent advancements and perspectives // Genetica 111(1–3):359–73. DOI: 10.1023/A:1013711919443.
11. Hilton E., Kunard B., Balazik M., Horodysky A. 2016. Review of the biology, fisheries, and conservation status of the Atlantic Sturgeon, Acipenser oxyrinchus oxyrinchus Mitchill, 1815 // J. App. Icht. 32(S1). DOI: 10.1111/jai.13242.
12. King, T.L., Lubinski, B.A., Spidle, A.P. 2001 Microsatellite DNA variation in Atlantic sturgeon (Acipenser oxyrinchus oxyrinchus) and cross-species amplification in the Acipenseridae // Conservation Genetics. V. 2. No. 2. pp. 103– 119. DOI: 10.1023/A:1011895429669.
13. Ludwig A., Debus L., Lieckfeldt D., Wirgin I., Benecke N., Jenneckens I., Williot P., Waldman J.R., Pitra C. 2002. When the American sea sturgeon Swam east // Nature. 419(6906), 447–448. DOI: 10.1038/419447a.
14. Ludwig A., May B., Debus L., Jenneckens I. 2000. Heteroplasmy in the mtDNA control region of sturgeon (Acipenser, Huso and Scaphirhynchus) // Genetics. V. 156(4), 1933–1947. DOI: 10.1093/genetics/156.4.1933.
15. Ludwig A., Belfore N., Pitra C., Svirsky V., Jennneckerns I. 2001. Genome duplication events and functional reduction of ploidy levels in sturgeon (Aciprenser, Huso and Scaphirhynchis) // Genetics. 158:1203–1215. DOI: 10.1093/genetics/158.3.1203.
16. Ludwig A., Arndt U., Lippold S., Benecke N., Debus L., King T.L., Mitsumara S. 2008. Tracing the first steps of American sturgeon pioneers in Europe // BMC Evol. Biol. 8: 214–221. DOI: 10.1186/1471-2148-8-221.
17. Ludwig A., Arndt U., Debus L., Rosello E., Morales A. 2009. Ancient mitochondrial DNA analyses of Iberian sturgeons // J. Appl. Ichthy. V. 25: 5–9. DOI: 10.1111/j.1439-0426.2009.01184.x.
18. Magnin E. 1964. Validité d’une distinction spécifi que entre les deux Acipenséridés: Acipenser sturio L. d’Europe et Acipenser oxyrinchus d’Amérique du Nord // Le Naturaliste Canadien, V. 91, 5–20.
19. May B., Krueger CC., Kincaid HL. 1997. Genetic variation at microsatellite loci in sturgeon: primer sequence homology in Acipenser and Scaphirhynchus // Canadian J. of Fisheries and Aquatic Sciences, 54, 1542–1547. DOI: 10.1139/cjfas 54-7-1542
20. Peng Z., Ludwig A., Wang D., Diogo R., Wei Q., He S. 2007. Age and biogeography of major clades in sturgeons and paddlefishes (Pisces: Acipenseriformes) // Mol. Phylogenet. Evol. 42:854– 62.
21. Popović D., Baca M., Panagiotopoulou H. 2015. Complete mitochondrial genome sequences of Atlantic sturgeon, Acipenser oxyrinchus oxyrinchus, Gulf sturgeon, A. o. desotoi and European sturgeon A. sturio (Acipenseriformes: Acipenseridae) obtained through next generation sequencing // Mitochondrial DNA. V. 27. № 4. 2549–2551. DOI: 10.3109/19401736.2015.1038799.
22. Paaver, T. 1996 A common or Atlantic sturgeon, Acipenser sturio, was caught in the Estonian waters of the Baltic Sea // Sturgeon quarterly 4 (3): 7. Paaver, T. 1997 Atlandi tuur — Eesti haruldasim kala // Eesti Loodustaed 5: 191–193.
23. Quantz, H. 1903. Störfischerei und Störzucht im Gebiet der deutschen Norseeküste // Mitteilungen des Deutschen Seefischerei-Vereins 19 (6): 176–204.
24. Robles F., Herman R., Ludwig A., Rejon C. 2005. Genomic organization and evolution of the 5S ribosomal DNA in the ancient fish sturgeon // Genome 48(1):18–28. DOI:10.1139/g04–077.
25. Ronquist F., Teslenko M., Van Der Mark P., Ayres D.L., Darling A., Hohna S., Larget B., Liu L., Suchard M.A., Huelsenbeck J. 2012. MrBayes 3.2: Efficient bayesian phylogenetic inference and model choice across a large model space // Syst. Biol. 61:539–42. DOI:10.1093/sysbio/sys029.
26. Timmermanns G., Melchers M. 1994. De steur in Nederland // Natura. 7: 155–158.
27. Wirgin I., Stabile J., Waldman J. 1997. Molecular analysis in the conservation of sturgeons and paddlefish // Environmental Biology of Fishes 48(1):385–398. DOI: 10.1023/A:1007306911163.
Рецензия
Для цитирования:
Митрюшкина Д.К., Киселева М.Н. Генетический подход в оценке биоразнообразия атлантических осетров Acipenser oxyrinchus и A. sturio (обзор современной литературы). Труды ВНИРО. 2023;194:44-49. https://doi.org/10.36038/2307-3497-2023-194-44-49
For citation:
Mitrushkina D.K., Kiseleva M.N. A genetic approach to assessing the biodiversity of Atlantic sturgeons Acipenser oxyrinchus and A. sturio (review of modern literature). Trudy VNIRO. 2023;194:44-49. (In Russ.) https://doi.org/10.36038/2307-3497-2023-194-44-49
Послать статью по эл. почте 